No ano 2017 (Nove anos após o episódio final de Ultraman Tiga), a TPC (Terrestrial Peaceable Consortium/Associação Pacífica Terrestre) tem se expandido para além da Terra, e criou uma nova equipe GUTS (Global Unlimited Task Squad/Esquadrão Global de Tarefas Ilimitadas), a "Super GUTS". Os seres humanos começaram por Marte, no que ficou sendo conhecido como a "Era da Neo Frontier".
No entanto, num certo dia, a Neo Frontier é atacada por estranhas esferas mais tarde denominadas Sphires. Em seguida, Shin Asuka e seus companheiros durante manobras de voo próximas da atmosfera da Terra são atacados pelas mesmas esferas. Asuka tem seu caça atingido, sendo obrigado a se ejetar, e enquanto ele está à deriva no espaço encontra uma luz muito brilhante…
É nesse momento que Asuka é salvo ao se fundir a um gigante de luz.